IOC R and scRNAseq trainings
La plateforme InforBio vous propose des formations en bioinformatique en ligne, en petits groupes, adaptées aux besoins des laboratoires de recherche. Nous proposons un parcours complet sur 6 mois, organisé en deux modules complémentaires.
Programme de la formation
Introduction à R pour l’analyse de données (novembre 2025 à janvier 2026) – 10 sessions de 3 heures – 800 €
Devenez autonome en R : maîtriser les fondamentaux, l’organisation et filtrage de données, les analyses statistiques de base, et la création de graphiques prêts pour publication. Aucun pré-requis.
| Week | Session | Semaine Prévue |
|---|---|---|
| Week 1 (in-person) | Kickstart with R: Your Gateway to Data Science | 03/11 |
| Week 2 | Data Foundations: Vectors and Matrices | 10/11 |
| Week 3 | More Complex Data Structures: Data Frames and Lists | 17/11 |
| Week 4 | Building Logic: Operators, Conditions and Functions | 24/11 |
| Week 5 (in-person) | Graphing with {ggplot2} (Part 1) |
01/12 |
| Week 6 | R-fresh: Revisiting the Essentials | 05/01 |
| Week 7 | Tidy Up: Wrangling Data with {dplyr} and {tidyr} |
12/01 |
| Week 8 | Graphs Level Up: {ggplot2} (Part 2) & Custom Functions |
19/01 |
| Week 9 (in-person) | Putting It All Together: Reproducible Analysis with Quarto | 26/01 |
| Week 10 | Your project presentation | A définir |
Analyse de données scRNAseq (mars à juin 2026) – 10 sessions de 3 heures – 2000 €
Apprenez à analyser des données de séquençage ARN en cellules uniques grâce à des cas pratiques. Vous travaillerez d’abord sur un jeu de données fourni, puis sur vos propres données, avec un retour personnalisé sur votre projet. Cette formation requiert une bonne maîtrise de R.
| Week | Session |
|---|---|
| Week 1 | Introduction |
| Week 2 | Quality Control & Normalisation |
| Week 3 | Dimensionality Reduction |
| Week 4 | Clustering (Part 1) |
| Week 5 | Clustering (Part 2) |
| Week 6 | Ingegration |
| Week 7 | Annotation |
| Week 8 | Multiome |
| Week 9 | Enrichment Analysis |
| Week 10 | Your project presentation |
La formation complète est proposée au tarif de 2500 €.
Points clés :
- Sessions en petits groupes pour un apprentissage interactif et individualisé.
- Mode hybride avec 3 sessions en présentiel et 7 à distance.
- Mise en pratique avec un projet individualisé présenté à la fin de chaque formation.
- Accompagnement personnalisé avec feedback sur vos propres données.
- Places limitées, inscriptions déjà ouvertes.
👉Inscription en ligne : lien
N’hésitez pas à nous contacter si vous avez des questions : inforbio@sorbonne-universite.fr
The InforBio platform offers you online training in bioinformatics, in small groups, adapted to the needs of research laboratories. We offer a complete course over 6 months, organized in two complementary modules.
Training Program
Introduction to R for data analysis (November 2025 to January 2026) – 10 sessions of 3 hours – €800
This course covers the basics of R, data organization and filtering, basic statistics, and creation of publication-ready graphics. The goal is to make you self-sufficient in using R for your own analyses.
| Week | Session | Planned Week |
|---|---|---|
| Week 1 (in-person) | Kickstart with R: Your Gateway to Data Science | 03/11 |
| Week 2 | Data Foundations: Vectors and Matrices | 10/11 |
| Week 3 | More Complex Data Structures: Data Frames and Lists | 17/11 |
| Week 4 | Building Logic: Operators, Conditions and Functions | 24/11 |
| Week 5 (in-person) | Graphing with {ggplot2} (Part 1) |
01/12 |
| Week 6 | R-fresh: Revisiting the Essentials | 05/01 |
| Week 7 | Tidy Up: Wrangling Data with {dplyr} and {tidyr} |
12/01 |
| Week 8 | Graphs Level Up: {ggplot2} (Part 2) & Custom Functions |
19/01 |
| Week 9 (in-person) | Putting It All Together: Reproducible Analysis with Quarto | 26/01 |
| Week 10 | Your project presentation | TBD |
scRNAseq Data Analysis (March to June 2026) – 10 sessions of 3 hours – €2000
Learn how to analyze single-cell RNA sequencing data through practical examples. You’ll work on a provided dataset and receive personalized feedback on your own projects. This training requires a proficiency in R.
| Week | Session |
|---|---|
| Week 1 | Introduction |
| Week 2 | Quality Control & Normalisation |
| Week 3 | Dimensionality Reduction |
| Week 4 | Clustering (Part 1) |
| Week 5 | Clustering (Part 2) |
| Week 6 | Ingegration |
| Week 7 | Annotation |
| Week 8 | Multiome |
| Week 9 | Enrichment Analysis |
| Week 10 | Your project presentation |
The complete training package is available for €2500.
Key Highlights:
- Small group sessions for interactive and personalized learning.
- Hybrid mode with 3 in-person sessions and 7 remote sessions.
- Hands-on practice with an individualized project presented at the end of each training course.
- Tailored feedback on your own data.
- Limited spots available, registration is now open.
👉 Register here : link
Feel free to reach out if you have any questions: inforbio@sorbonne-universite.fr